Operaciones permitidas por cada aduana
| Aduanas | Operaciones permitidas | competencia territorial |
| Terrestre de San Bartolo | Importaciones definitivas, tránsitos aduaneros, vehículos usados, repuestos usados, menajes de casa, equipaje de viajeros, Admisión Temporal para Perfeccionamiento Pasivo, Importación Temporal, Franquicias, Encomiendas, Reexportaciones. | —.— |
| Marítima de Acajutla | Importaciones definitivas, tránsitos aduaneros, repuestos usados, menajes de casa, equipaje de viajeros, Admisión Temporal para Perfeccionamiento Pasivo, Importación Temporal, Franquicias, Encomiendas | —.— |
| Aérea de Comalapa | —.— | —.— |
| De Pasajeros de El Salvador (Comalapa) | —.— | —.— |
| Terrestre de Las Chinamas | —.— | —.— |
| Terrestre de La Hachadura | —.— | —.— |
| Terrestre de Santa Ana | Importaciones definitivas, tránsitos aduaneros, Repuestos Usados, Menajes de Casa, equipaje de viajeros, Admisión Temporal para Perfeccionamiento Pasivo, Importación Temporal, Franquicias, Encomiendas, Fardos Postales, | —.— |
| Terrestre de San Cristóbal | —.— | —.— |
| Terrestre de Anguiatú | —.— | —.— |
| Terrestre de El Amatillo | —.— | —.— |
| Marítima de La Unión | —.— | —.— |
| Terrestre de El Poy | —.— | —.— |
| De Fardos Postales | Importaciones definitivas por la vía postal. | —.— |
| Delegación de Aduanas de Zona Franca San Marcos | —.— | —.— |
| Delegación de Aduanas de Zona Franca El Pedregal | —.— | —.— |
| Delegación de Aduanas de Zona Franca | —.— | —.— |
